城中的一些长老，在群龙无首的情况下，主张开城投降，以求大汗应允保全全城人的性命。可是城内的一些主战人士仍主张不惜一战。成吉思汗于是下令火攻，所有内城的官舍房屋瞬即陷入一片火海。
军队蜂拥进入城中，抢劫牛羊粮食。图书馆均成了马厩，古兰经在马蹄下践踏。居民们看见有一年事已高的老人，身穿黑色盔甲，头戴羽饰护盔，神貌不凡。
“这人是谁？”民众好奇地问。
“嘘！小声点！”老人压低声音说，“他就是成吉思汗。”
布哈拉的富户都被逼迫献出财物，蒙古军所到之处掠夺奸淫，男人不甘妻女受辱，奋起反抗，却惨遭杀害。生离死别，哭声震天。同时火势席卷全城，浓烟蔽日，俘虏被驱往撤马尔罕城，稍有落后，便遭鞭斥，国破家亡的情景令人惨不忍睹！
成吉思汗继续向撒马尔罕进兵。这个地方从八世纪起，就以造纸术而闻名中亚。蒙古军很早就听说撒马尔罕的繁华，一时精神百倍，朝着这座繁华的大城前进。他们的军队中还有从布哈拉带来的俘虏们。经过五天的行程，到达了撒马尔罕郊外。在这儿，一望无际的草原，林木繁茂，果实累累，成吉思汗在河边扎营，商讨作战计划。